Biochimie et thermo

Question d’examen de juin 2012

- Que devient le NADH cytosolique ?
- Expliquer le modèle de Monod-Wyman-Changeux
- Structure tertiaire et quaternaire des protéines (rôle dans la stabilisation des protéines)
- Rôle amphibolique du cycle de Krebs
- La régulation de la néoglucogenèse
- Formule de thermo à expliquer
- Cycle de Krebs + les 2 types de fermentation
- L’énergie libre en fonction des produits et des réactifs dans une réaction réversible.
- Dégradation du glycogène dans le foie
- Repliement des protéines de manière indépendante
- Phosphorylation oxydative
- Structures secondaires
- Destinée du lactate musculaire après glycolyse : le cycle de Cori
- Déterminer la forme prépondérante de l'acide aspartique à pH3
- Cycle de l’urée
- Transamination
- Triade catalytique
- Destinée du pyruvate
- Enzyme allostérique

Explication complémentaire du graphique de Ramachandran

Les 2 cadres à gauches sont les structures secondaires des protéines et les 2 cadres à droites sont ceux des structures interdites (sauf là où il y a des points). Le 1er cadran (haut gauche) est celui dans lequel se trouvent les feuillets beta parallèles et anti-parallèles. Le 2ème cadran (haut droite) est celui des hélices alpha gauche et le 3ème cadran (bas gauche) est celui des hélices alpha gauche. Si l’angle phi est de 0, la protéine est question est la proline. La glycine quant à elle présente des points répartis plus ou moins uniformément sur toute la surface du graphique car sa chaine latérale est très petite.

oui effectivement c'est l'inverse...

tout dépend de si l'acide aminé de départ est chargé + (acide aspartique par ex) ou + (genre ... histidine) niveau chaine latérale

Logiquement c'est l'inverse non ? Quand t'es negatif t'es sel pcq tu peux fixer des ions positifs et quand t'es positif t'es chlorure car tu peux fixer des ions négatifs (Cl-); non?

pcq t'es en chlorure lorsque t'es neg et en sel lorsqu t'es positif

dans l'examen envoyé par marie sur myulg, a la question 1 on nous demande a partir de quelles valeurs de PH l'aide aminé lysine se trouve uniquement sous forme de sel sodique? et la on nous donne PH>12 comme réponse. Pour etre sous forme de dichlorure de lysine on dit qu il faut un PH < 2. Pq? je pige pas les 2 réponses!

Pas vu, non.

ds le chapitre sur les enzyme on n'a vu les methide de hanes et woolf et de fladie-hoftsee pr les graphique?

En fait, c'es 12*60*60, donc le temps (c'est ainsi que tu trouves la vitesse en fait)

ds l'exercice avec le lactose transformer en glucose et galactose (ex donne en classe) j'ai Vm= 5.94*10^-3/43200, je ne vois pas d'ou viens ce 43200, peut-on m'aider?

toujours pour le mm type d'exercice:
pour le tryptophane, on prend le pka de la fct NH2 ?
et quel est le pka de la proline ?

question pour les charges partielles d'un polypeptide à un ph donné:

dans la photo 1 de marie ange: à ph=3.1 pour un polypeptide ala-ser-glu-his-lys
pour la lysine elle trouve -0,1 alors que je trouve -0,8 en faisant le calcul:
ac/base=10^-pka/10^-ph
quelqu'un aurait une idée de l'erreur ?

Perso, dans le calcul des forces de VDW, j'ai juste mis que A et B était liés au système, mais je pense que c'est le seul truc qu'il ait dit à propos de ça. C'était trop compliqué pour ce que c'était intéressante dans mes souvenirs.

ds la syllabus page 4 qq peut m'expliquer pq ds l'ex haut de page on fait 7*-65 pr calculer le deltaH?

la pression partielle de l'o2 c'est 100 ou 200 torr ds l'air?

je parle du syllabus

si tu parles d'un truc su sylabbus "pirate" je ne sais pas t'aider
si tu parles d'un truc dans les diapos, on parle de rA et rB rayons de VdW de A et B

ms quoi? leur electronegativite, leur charge, leur rvdw? ca doit etre une donnee chiffree je suppose

Pour A et B oui ça doit être ça

Stephane, t'es sur de ta réponse? car pour moi quand on veut du dichlorure de lysine, on travaillera a un pH supérieur au Pka de la lysine

Atome A et Atome B je pense...

Pr les liaison de vdw ds l'equation de l'energie, A et B corresponde a quoi?

a la question 1 de l'examen de 2007-2008, on nous demande quel ph doit avoir la lysine pour etre uniquement sous forme de dichlorure de lysine? La réponse est PH <2. Pourquoi? Je comprends pas ce 2.

c'est quoi que tu ne comprends pas exactement?
http://www.cours-pharmacie.com/biochimie/chaine-respiratoire-et-phosphorylation-oxydative.html

il y a une video qui peut p-t t'aidee

QQn saurait-il m'expliquer le fonctionnement les 2 derniers complexes (cytochrome c réductase et cytochrome c oxydase) dans la phosphorylation oxydative? Merci